Polski Komitet EAPN działa na podstawie Statutu, który został przyjęty przez Zgromadzenie Ogólne EAPN Polska.

Organem powołanym do zarządzania jest Rada Wykonawcza, w skład której wchodzą w kadencji 2024-2028 następujące osoby:

1. dr hab. Ryszard Szarfenberg (Uniwersytet Warszawski, ATD Czwarty Świat) – Przewodniczący
2. Cezary Miżejewski (Ogólnopolski Związek Rewizyjny Spółdzielni Socjalnych) – Wiceprzewodniczący
3. Krzysztof Balon (Fundacja Dialog Europejski) – Wiceprzewodniczący
4. Kamila Płowiec (Stowarzyszenie Arkona) – Sekretarz
5. Katarzyna Lisiecka (Stowarzyszenie MONAR)
6. Julia Wygnańska (Fundacja Najpierw Mieszkanie)
7. Bartłomiej Głuszak (Federacja Organizacji Socjalnych Województwa Warmińsko-Mazurskiego)

Rada Wykonawcza spotyka się raz na 2 miesiące w Warszawie.

Organem kontrolnym jest Komisja Rewizyjna, w skład której w kadencji 2024-2028 wchodzą następujące osoby

1. Wojciech Jaros (Federacja Polskich Banków Żywności) – Przewodniczący
2. Joanna Sadzik – Stowarzyszenie Wiosna
3. Urszula Weber-Król – Stowarzyszenie Blisko Dziecka